起床后手指疼可能与以下几种因素有关：
1.腱鞘炎。如果手指关节部位存在狭窄性腱鞘炎，在晚上睡觉时，手指部位着凉或者是受到压迫以后，在早晨时就会出现手指疼痛、晨僵、弹响等症状，可考虑进行封闭治疗或者是手术治疗。
2.类风湿关节炎。也会导致起床后手指疼痛，通常对称性出现，在严重时还会导致关节部位出现畸形。确诊后应尽早进行抗风湿治疗，防止病变加重。
3.强直性脊柱炎。当强直性脊柱炎在加重以后，会累及全身的各个关节，在早晨起床时就可出现手指疼痛、僵硬的症状。