硬化萎缩性苔藓，目前尚无特效疗法，只能对症治疗进行改善。硬化性萎缩性苔藓好发于绝经后的女性，通常认为与雌激素下降有关系，因此，可以外用性激素制剂的药物进行涂抹，如丙酸睾酮软膏、乙烯雌酚软膏等。
此外，还可以外用糖皮质激素乳膏，但不能长期使用。皮损好转后可使用钙调磷酸酶抑制剂，如他克莫司或吡美莫司。同时也可以口服维生素E软胶囊。
此外，还可以进行照射氦氖激光，改善局部的循环。需要注意的是，少数患者可出现癌变，因此平时需要观察皮损的变化，及时发现并治疗。