传染性软疣和毛囊炎的区别在于发病的原因、临床症状以及治疗手段上。
传染性软疣的发病原因是因为皮肤表面感染了痘病毒而引起，而毛囊炎则是因为毛囊内部滋生了大量的细菌而引发。在临床症状上，传染性软疣主要表现为散在分布的一些小丘疹，这些丘疹呈黄色、肉色，顶端可以见到凹陷性质的表现。而毛囊炎则主要呈现为红色的炎性丘疹，中间没有凹陷，则表现为突出，而且伴随着按压性疼痛。
在治疗方面，传染性软疣建议选择把疣体内部的白色的软疣小体夹出来就算是治疗好。而毛囊炎则建议选择使用消炎类的药物来进行治疗。