头顶酸胀痛可能与生理性的因素有关。常见于平时过度劳累、经常熬夜、思想压力太大、思虑过多等因素，这些不良的因素容易引起大脑神经功能紊乱，就会表现出头顶酸胀疼痛的症状，还可能会伴有头晕、感觉无力等不适表现。
也可能与病理性的因素有关，尤其是本身存在血压、血脂异常，当受到某些不良因素的刺激后，导致情绪过度波动，致使脑血管出现短暂性的痉挛，也容易引起头顶酸胀疼痛。
此外，脑炎脑膜炎等颅内感染性疾病，或者是脑梗塞脑出血等脑血管疾病，都可导致患者出现头顶酸胀疼痛。