肺孢子菌病，也称为卡氏肺囊虫病。
它是一种机会感染性疾病，主要为空气传播和体内潜伏状态肺孢子菌的激活。临床主要见于早产儿或营养不良患儿，年龄多在2到6个月之间，起病常隐匿，进展缓慢，出其大多有拒睡、食欲下降、腹泻、低热、体重减轻、逐渐出现干咳、气急，并呈进行性加重，发生呼吸困难，鼻翼扇动和发绀，病程一般3到8周，如不及时治疗，可死于呼吸衰竭，病死例为20%到50%。
还有一种多见于免疫缺陷患者，如化疗或器官移植者，并发肺孢子菌时，病情进程迅速，而艾滋病患者并发肺孢子菌时，进展较缓慢，未及时发现和治疗的患者，其病死率高达70%到百分之百。