闭经分为原发性闭经和继发性闭经。闭经指年龄超过13岁，第二性征未发育；或年龄超过15岁，第二性征已发育，月经还未来潮。
继发性闭经指正常月经周期建立后，月经停止六个月，或者按自身原有月经周期计算停止三个周期以上。
正常月经的建立和维持，有赖于下丘脑-垂体-卵巢轴的神经内分泌调节，靶器官子宫内膜对性激素的周期性反应和下生殖道的通畅。其中任何一个环节发生障碍，均可导致闭经。原发性闭经比较少见，多为遗传原因或先天性发育缺陷引起，约30%患者伴有生殖道异常。
根据第二性征的发育情况，分为第二性征存在和第二性征缺乏两类。继发性闭经病因复杂，下丘脑性闭经最常见，还包括垂体性闭经、卵巢性闭经、子宫性闭经和下生殖道性闭经。下丘脑性闭经最常见，包括精神刺激、体重下降、运动性闭经、药物性闭经。
垂体性闭经，病变主要在垂体，包括垂体梗死、垂体肿瘤。卵巢性闭经，主要是卵巢的性激素分泌低下，包括卵巢早衰、卵巢功能性肿瘤、多囊卵巢综合症。
子宫性闭经是因为感染创伤导致的宫腔粘连引起的闭经。还有子宫切除、放疗引起的闭经。
其他内分泌功能异常，包括甲状腺、肾上腺，胰腺等功能紊乱，也可以引起闭经。