脑血栓会引起呼吸衰竭。主要出现于大面积脑血栓的患者，由于患者会出现意识障碍，长期卧床，容易使肺部出现炎症或者是肺栓塞，导致呼吸衰竭。
脑血栓患者还非常容易出现肺部感染，也会导致呼吸衰竭。如果患者的小脑脑干部位出现了梗塞，可能会引起四肢瘫和球麻痹，容易使患者出现吸入性肺炎。反复的出现肺炎，就会引发呼吸衰竭。如果脑血栓比较严重，出现了脑干梗死，就会影响到人体的呼吸中枢，从而使患者出现昏迷、呼吸困难，最终引发呼吸衰竭。
脑血栓患者出现呼吸衰竭的情况后，应当及时的用气管插管或者是气管切开，给予呼吸机辅助呼吸治疗原发病。