原发性脑干损伤在颅脑损伤中占有较大的比重，其死亡率较高，原发脑干损伤通常指暴力作用于头部引起脑干为主的损伤，约占重症颅脑损伤的百分之五到百分之七，并于伤后立即发生时间较长的意识丧失或死亡。
而外力造成的脑干损伤后立即出现意识障碍，如意识模糊、浅昏迷、昏迷和深昏迷，是由于皮层、皮层下结构和脑干的弥漫性轴索损伤的结果。
因此原发性脑干损伤比继发于外力造成的脑干损伤更重。原发脑干损伤与继发性脑干损伤的区别在于症状、体征出现的早晚。