内膜只有三毫米不能做试管婴儿的。因为现在子宫内膜厚度过薄，不利于受精卵的着床，而且就算着床之后，也容易出现流产或者是胎儿停止发育等异常情况。
子宫内膜厚度低于7毫米时，不能做试管婴儿，要检查导致子宫内膜薄的原因治疗。比如雌激素水平低或是宫腔手术，造成子宫内膜受损、宫腔粘连等都会导致子宫内膜薄，可以通过补充雌激素类药物，增厚子宫内膜，若有粘连情况就要做分离手术。
多吃含有雌激素的饮食，等子宫内膜恢复正常厚度后，才可以做试管婴儿，做试管婴儿前也要做相关的检查。