支原体、衣原体感染通常是由于身体免疫力下降，病菌入侵身体而导致，可以引发急性呼吸道感染、男性泌尿生殖系统感染、女性的妇科病和沙眼衣原体感染。但这两种病原体都具有一定传染性，可通过性接触传播，故患者应注意隔离治疗。
在治疗上，可采用大环内酯类药物，如罗红霉素、阿奇霉素等，此类药物不仅成人可以应用，儿童也可以使用。还可采用喹诺酮类药物，如左氧氟沙星、莫西沙星等，此类药物可用于支原体、衣原体引起的泌尿系统感染。但需要注意，此类药物不适用于18岁以下的儿童及青少年。
另外，肺炎支原体感染时可用四环素类药物进行治疗，如多西环素、米诺环素等药物。需要注意，不建议患者在牙齿生长发育期，包括怀孕后期、婴儿期以及8岁前儿童等使用四环素类药物，否则可能会造成永久性牙齿变色。