女性如果有卵巢巧克力囊肿，通常是可以有性生活，可以同房的。只要巧克力囊肿没有出现破裂，也没有出现扭转。这是因为女性的巧克力囊肿是在盆腔内，而同房是在阴道内，所以，并不会因为同房直接刺激到卵巢的巧克力囊肿。
但是有一些女性卵巢巧克力囊肿太大，可能在同房的过程中会出现巧克力囊肿的破裂或者是受到扭转，虽然发生这种几率的可能性比较低。还有一些卵巢巧克力囊肿的女性，在同房的时候如果太过于暴力会引起腹部有疼痛的症状，在同房结束以后这种症状是可以逐渐地、慢慢地缓解。
所以，建议有巧克力囊肿的女性在同房的过程中尽量温柔。