儿童脑囊肿手术以后有可能会影响智力，但是一定要结合具体病情，来判断分析。
假如患者脑囊肿体积不是非常大，手术前并没有影响孩子的智力发育。只是一些手脚偏瘫、失语、癫痫、发烧等症状，这样手术以后及时解除了脑囊肿问题，患者不会出现智力发育受影响的现象。原先的一些神经功能障碍也会逐渐地好转，得到控制。
但是有些患者囊肿很大，已经影响到智力发育，这样即使做了手术，也有可能不能够完全恢复，会留下智力低下的后遗症。还有一些手术以后出现了一些并发症，比如感染以及出血等，这种情况下也有可能会影响智力的发育。