在应用两个月重组人干扰素阴道泡腾胶囊期间发现怀孕，宝宝是可以保留的。首先干扰素在正常剂量下使用，对人体是没有太大危害的，并且这个药物主要是提高机体的免疫力，用于抗病毒的治疗，它可以增强机体的体质。
在用于阴道上药期间如果怀孕，这个时候精子和卵子还没有结合，受精卵是不会受到药物的影响的，并且是阴道上药来进行治疗的，通过血液吸收进入人体内，影响受精卵的可能性是很小的。所以在用药期间一旦发现怀孕，并不需要做人流手术终止妊娠，可以保留这个孩子，孕期定期检查就可以了。