弓形虫病和隐孢子虫病均为人畜共患病，同时都存在一定机会性发病趋势。在临床上，两种疾病均缺乏特异性治疗。
对于弓形虫病，目前临床上可以在医生指导下选择磺胺类药物进行治疗。隐孢子虫病在临床上，可以在医生指导下选择生长因素或免疫球蛋白等药物进行治疗。
由于两种疾病均存在机会性发病特点，常见于患有影响免疫能力疾病的人群，或者在重大打击下出现免疫能力一过性异常人群。一般建议存在高发因素人群，在日常生活中加强预防。