肾结石的预防主要是通过饮食和饮水方面。饮水方面每天需要多喝水，保证尿量在2000毫升以上，特殊类型的肾结石，需要尿量在3000毫升以上。根据结石的成分不同，饮食方面需要注意的也不相同：
对于草酸钙类结石，需要注意减少食物中草酸含量高的食物摄入，比如杏仁、花生、甜菜、菠菜、大黄等等。此外不可喝红茶，可以多喝橙汁、柠檬水等。
对于尿酸类结石的预防，主要是减少食物中嘌呤的摄入，减少海鲜类食物、肉类的摄入，注意禁止饮酒，尤其是啤酒。胱氨酸结石应减少大豆、小麦、鱼、蘑菇等食物摄入。