灰指甲甲板增厚，可以用小刀或者是指甲锉磨磋增厚的甲板，然后再涂抹抗真菌类软膏，也可以外用40%的尿素软膏，封包增厚的病甲，使指甲软化、剥离，然后再涂抹用药。并且需要坚持用药，一直到新的指甲长出来为止。
针对病程较长的患者，除了局部用药之外，也可以通过口服抗真菌药物进行治疗，临床上可以选择服用伊曲康唑胶囊，或者是特比萘芬片等药物。但是在口服抗真菌药物之前以及用药期间，都应该检查肝脏功能，因为这一类的药物容易造成药物性的肝损伤。
需要尽早采取治疗措施，以免传染给其他的指甲。