引起阴茎肉疙瘩的疾病可见于尖锐湿疣、阴茎皮肤皮脂腺感染、过敏等，跟病毒、病菌感染、敏感物接触等有关。
1.尖锐湿疣。病毒感染常发生于高危性行为后，受到性伴侣人乳头瘤病毒感染引起菜花样肉疙瘩。
2.阴茎皮肤皮脂腺感染。阴茎部位卫生护理不好、皮肤破损等导致大肠杆菌等感染皮肤以及皮下的皮脂腺，导致组织炎性充血、水肿即可形成肉疙瘩样外观。
3.过敏。进食海鲜、接触粉尘环境等，导致阴茎皮下组织液渗出形成的肉疙瘩样外观。
长时间存在的肉疙瘩，并且无伴随症状，要考虑是个体生理性变异导致的皮脂腺异位症、珍珠疹。