免疫荧光染色诊断包括两个部分，即免疫荧光染色技术和结合免疫荧光染色结果进行病理诊断两个部分。免疫荧光染色技术的原理是根据抗原抗体特异性的结合反应，把已知的抗体标记上荧光素制成能激发荧光的抗体，然后以它作为探针来检测组织和细胞内的相应抗原。免疫荧光染色的步骤与免疫组化染色基本相似，但染色完成后的切片需要在特定的荧光显微镜下观察，根据其形成的免疫复合物所发的荧光来确定检测物的来源、性质和部位。
由于目前大部分免疫荧光染色完成后，荧光信号会随着时间的延长逐渐减弱甚至消失，所以，一旦免疫荧光染色完成，应及时的完成显微镜下的观察和病理诊断。免疫荧光染色技术一般用于细菌、病毒微生物的快速诊断以及肾脏穿刺活检、皮肤活检等病理诊断领域。病理医生应结合荧光显微镜下的观察结果和临床资料等全面分析病变进行综合判断，才能做出可靠的病理诊断。