接种疫苗是预防黄热病的最重要、最基础的措施。目前，黄热病疫苗是安全、有效的。一次接种即可为机体提供终身保护。
一般而言，从接种疫苗之日起，需要大约2周时间，才产生对黄热病病毒的免疫力。在黄热病流行地区，这2周需采取防蚊的个人保护措施。可以穿防护性衣服，在蚊帐中睡觉，并使用建议的驱虫剂等。
黄热病疫苗接种证明大部分人可从接种后10天左右起生效。其副作用一般比较轻微。可能包括头晕、头痛、全身肌肉疼痛和低烧等。