结肠闭锁大部分都是先天性引起，是新生儿时期肠梗阻的常见原因之一。
目前发病机制暂不十分明确，通常认为是由于胚胎发育阶段空化不全所致；也有人认为是由于胎儿肠道血液循环障碍，阻碍了其正常发育所致。在胎儿期结肠并没有发育好，出生后主要表现为腹痛、恶心、呕吐并且黄疸持续加重。
确诊之后主要的方法仍然是以手术为主。治疗的方法都是根据患者的情况在术中决定，可以行结肠的部分切除，有时病变部位比较大，可能需要结肠的大部分切除，甚至是全结肠切除。