脑血栓的患者一般情况不需要进行手术治疗，以药物治疗为主。比如早期，如果适合溶栓症可以进行溶栓治疗，如果超过溶栓治疗时间窗，应尽早口服阿司匹林或氯吡格雷抗血小板聚集治疗。
同时要给予改善血液循环，常用的药物有舒血宁和维脑路通，并给予脑保护治疗。同时应用丁苯肽以改善症状和体征，病情稳定后可以进行康复治疗和针灸治疗。
如果是大面积的脑梗死患者可能会出现高颅压，严重时可以引起脑疝，危及患者的生命可以进行手术治疗。主要是切除部分脑组织临时缓解高颅压，从而挽救患者的生命。
脑血栓是由于患者严重血管狭窄而导致，如果脑动脉狭窄大于75%以上时，可以考虑直接介入手术治疗。