首先需要明确病因，胃里有胆汁大多数是胆汁反流引起的，常因胃的幽门功能发生紊乱，幽门括约肌的机能失调造成。
药物治疗主要包括改善胃动力药物，可促进胆汁排空，改善幽门括约肌功能，抑制胆汁反流。抑制胃酸常用药，比如奥美拉唑，可以减轻胃酸对黏膜损伤，黏膜保护剂，特别是铝碳酸镁，可以与胆汁中胆盐结合，减轻胆汁对黏膜损伤。
病情比较重的病人可以服用熊去氧胆酸，效果比较好。治疗过程中要避免使用引起反流药物、影响胃动力药物，比如解痉药等，还要避免服用刺激胃药物和非甾体类药物。