菌血症治疗方法主要是病因治疗和并发症的预防。菌血症是细菌由病灶入血，血液中出现微生物并出现一系列的症状的疾病。
多是由于外科操作或者手术，例如下尿路插管、脓肿切开、心内导管或者牙科手术等出现，还有静脉吸毒者也可见。治疗上，外科置管等引起的短暂性的菌血症，可以不予以治疗。
但是对于有心瓣膜功能不全的患者，应该预防性使用抗生素治疗。对于有严重感染的菌血症，应该立即查明病因，并且及时去除置管，对原有疾病在取得化验标本后，应该经验性使用抗生素。