幽门螺旋杆菌主要感染胃和十二指肠。幽门螺杆菌是主要通过消化道传播，比如共用餐具、一起吃饭等途径经口腔进入消化道。幽门螺杆菌进入胃内后能够产生一些酶，抵抗胃内的酸性环境，还能产生一些损害因子，损伤胃黏膜，长期导致慢性胃炎、消化性溃疡，甚至胃癌。部分幽门螺杆菌还可以寄生在十二指肠内，导致十二指肠溃疡。
感染幽门螺杆菌后一定要及时清除，否则会增加罹患胃癌和胃淋巴瘤的风险，可以口服药物清除幽门螺杆菌，口服四联根除方案二周一般能够清除。四联方案具体包括二种针对幽门螺杆菌的消炎药，比如阿莫西林、克拉霉素，一种抑制胃酸分泌的质子泵抑制剂，比如奥美拉唑，一种铋剂，比如枸橼酸铋钾。
按照上述疗程用完药后停药一个月复查碳13或碳14呼气试验，看是不是根除了幽门螺杆菌。如果没有根除，还需要换用其它的方案治疗。