子宫内膜过薄的治疗包括病因治疗、饮食治疗和药物治疗。
1.如果子宫内膜过薄是由于做了多次人工流产手术或清宫手术而导致。应该尽量避免此类手术操作，增加含雌激素类食物的补充，比如豆浆、牛奶、鸡肉、鱼肉等食物，给予雌激素类的药物增加子宫内膜厚度，促进内膜恢复。在子宫内膜增长到一定厚度后给予孕激素进行撤退性出血，也就是雌孕激素周期治疗。也可以规律性服用短效避孕药进行治疗，如妈富隆、优思明、优思悦等。
2.如果子宫内膜过薄由于子宫内膜结核导致，应该积极进行规范化的抗结核治疗，全程、足量、规范用药反应，并在抗结核治疗同时，补充足够的营养，增加含雌激素类饮食。
3.如果子宫内膜过薄由于血液淤滞、气血不足、肾气不足等原因导致，可以给予小量阿司匹林改善子宫内膜血供，并且口服补肾养血的药物进行改善，比如熟地黄、山药、当归、川芎、阿胶、鸡血藤等。