在胃肠炎发病期间，应该继续用抗病毒的药物，利巴韦林配合涩肠止泻的药物蒙脱石散进行保护肠粘膜、止泻的作用。
在这期间饮食应该以清淡饮食为主，应该以低脂少纤维、少油腻食物、饮食为主。在这期间蒸调的方法应该以蒸、炖、或者煮为主，尽量不要吃油炸类的食品，不能吃辛辣刺激性的食物。在这期间不能吃韭菜、芹菜、洋葱这一类刺激性的食物。这些食物会容易加重胃肠炎的症状。还应该注意蛋白质及维生素的摄入。在日常饮食生活当中，应当选一些易消化的优良的蛋白质饮食，比如鱼、蛋、豆制品以及维生素丰富的嫩绿蔬菜、鲜果汁，这些能够补充腹泻所导致的营养消耗。
慢性肠炎性病人消化吸收功能比较差，应当采用比较容易消化的半流质饮食，或者是少渣饮食为主。