咳嗽咽痛这种情况，最常见的原因是急性上呼吸道感染。
急性上呼吸道感染典型的表现是流清水鼻涕、打喷嚏、鼻塞、咽痛、咳嗽的症状，还有可能会头痛、肌肉酸痛、低热的表现，也有一些急性上呼吸道感染的患者，可能仅仅是咳嗽、咽痛这种症状。另外流行性感冒这种疾病也是可以出现咳嗽、咽痛的，但是流行性感冒通常会出现高热的表现。
除了这些感染性的疾病以外，还需要注意排查一些非感染性的疾病，比如胃食管反流是可以引起咳嗽的，而且胃食管反流可以伴随有反流性的咽炎，病人通常会伴随有咽痒，但是严重的反流性咽炎，也有可能会出现咽痛这种情况。