胎儿兔唇有一部分原因是遗传的因素导致的，比如父亲是兔唇病人，后代发生率为3%，母亲为兔唇病人时后代发生率为14%。
如果孕妇在怀孕早期有不良环境接触史，或者接触有毒、有害的物质，比如吸毒、药品、化学物质等，或者孕妇以前怀孕过兔唇的胎儿，这些都有可能导致胚胎发育受到影响，从而导致兔唇的发生。
目前的产前诊断比较困难，超声也只能发现比较明显的兔唇，对于合并有严重腭裂的，在产前很难被发现的，胎儿兔唇在新生儿期做整形矫正治疗的效果是比较好。