表浅型的心肌桥，因为薄而短，对冠脉血流影响小，多数患者没有明显的心肌缺血症状以及相应的心电图改变，所以一般不需要给予特殊的治疗。
如果对于纵深型的心肌桥，患者因为心肌桥厚而长，对冠脉血流影响大，常常出现心绞痛，心电图出现心肌缺血的改变，甚至会诱发心肌梗死等症状，这种患者就要给予积极的治疗，可以采用药物治疗和手术治疗，药物可以给予β受体拮抗剂及钙通道阻滞剂等降低心肌收缩力的药物，可以有效缓解症状。
如果药物治疗不能控制，可以给予手术治疗，手术治疗主要是指外科搭桥术，不主张在心肌桥内植入支架。