生殖器疱疹是临床非常常见的一种性传播疾病，传染率比较高，发病率也比较高，不容易治愈。生殖器疱疹的治疗主要通过足量、足疗程的抗病毒治疗。
主要选用的是阿昔洛韦胶囊、泛昔洛韦胶囊、伐昔洛韦胶囊口服治疗。同时外用阿昔洛韦乳膏、干扰素凝胶涂抹。
对于严重的疱疹可以使用膦甲酸钠注射液静脉输液，同时需要口服提高免疫力的药物。比如：复方甘草酸苷胶囊、胸腺肽肠溶片。如果生殖器疱疹伴随着感染，可加用5％红霉素软膏或者莫匹罗星乳膏等药物外涂。