后半夜咳嗽有可能是咳嗽变异性哮喘，接触过敏原，如花粉、粉尘、进食海鲜类食物之后导致哮喘急性发作，出现咳嗽的症状。一般干咳为主，要积极的抗炎平喘处理。
也有可能是感冒发生时，病毒侵犯支气管，使支气管粘膜充血水肿产生炎症导致的咳嗽、咳痰的症状。可服用一些抗病毒药物，如奥司他韦胶囊。
还有可能是肺部感染发生时，出现咳嗽、咳痰的症状，要根据痰培养药敏的结果，积极的抗炎抗感染治疗。服用止咳糖浆对症处理，同时多喝温开水，避免进食辛辣刺激性油腻的食物。