肠道病毒所致的各系统感染，首先是给患者口服抗病毒药物，但是要明确具体的感染病原微生物的种类后，选用药物治疗，可以缩短疾病的疗程。同时还需要根据患者的临床表现，给予口服对症处理的药物。
假如肠道病毒感染以后，导致患者出现了手足口病等临床表现时，需要及时的给予外用止痒膏药，并且有可能还需要口服抗炎药物。假如口腔疼痛较为严重，引起食欲下降，吞咽时疼痛加剧时，需要及时地给予口服保护口腔黏膜的药物，或者是外用口腔喷雾剂缓解症状。
因此，具体情况具体分析。因为肠道病毒所导致的感染，在每个患者身上的临床表现有所不同。