痔疮上长肉芽的治疗方法需要结合肉芽的性质，在临床上常见的有以下几种情况：
第一，炎性肉芽，一些痔疮会导致局部感染或者破损、而当局部皮肤缺损反复的受炎症刺激以后，会导致破损处肉芽增生而形成炎性肉芽，患者需要考虑行手术治疗，可以连同痔疮以及肉芽一并切除。
第二，肛乳头纤维增生，由于痔疮反复的脱出，有可能会刺激齿线处的肛乳头出现纤维增生，看去会像一个肉芽一样，小的并不需要特殊处理，而大的需要考虑手术切除。
第三，肛周尖锐湿疣，当尖锐湿疣生长于痔疮于表面皮肤时，就会导致痔疮上长肉芽，形似菜花样，需要通过电灼、激光、冷冻等方法去除疣体。