患者患有口腔念珠菌病时，应及时前往当地正规医院的口腔科进行诊治。
在经济发展水平较高的地区，医院综合诊治能力较高，可能会将疾病科室分得更细。如果有口腔颌面外科或者口腔黏膜科，患者可前往该科室进行治疗。
另外，在经济发展水平较低的地区，由于限制因素较多，医院内可能仅有口腔科，患者则应前往口腔科就医诊疗。如果医院没有口腔科，患者则可以前往消化内科进行就诊。若患者仍旧辨别不清应前往的科室，可以向医院前台进行咨询。