肌肉萎缩和重症肌无力的区别主要有以下几方面：
首先，二者的病理改变并不相同。肌肉萎缩主要是考虑肌肉营养方面出现障碍导致，包括肌肉的支配神经出现了异常，导致神经营养障碍。肌肉本身产生了损伤破坏或者由于废用性原因导致肌肉的营养代谢出现异常，产生肌肉的纤维萎缩，体积减小、力量下降等症状。重症肌无力是一种神经肌肉接头出现了问题，也就是神经对肌肉控制和传导下降，从而产生肌肉的无力症状，肌肉本身可能并没有明显的异常改变。
其次，二者的症状表现并不相同。肌肉萎缩一般是见于相应的局部肌肉，出现纤维的变性体积变小，比如出现肢体的肌肉萎缩。而重症肌无力常常是表现为全身的肌肉无力，包括头面部的肌肉、呼吸肌以及四肢的肌肉力量。
再次，在治疗方面不同。肌肉萎缩主要是根据病因来进行相应的治疗，预后一般还是比较良好。而重症肌无力主要是来促进神经和肌肉的传导来缓解症状。