男性生殖器发炎、流脓，可能有两种原因。
其中最常见的原因是感染淋球菌导致的淋球菌性尿道炎，是一种比较常见的性传播疾病，潜伏期在3~7天左右。脓性分泌物是从尿道流出，脓液质地一般较浓稠，可以伴有尿频、尿急、尿痛、尿道灼热感明显症状，检查尿常规可见白细胞明显升高，脓液可以发现革兰氏阴性双球菌。
另外，阴茎海绵体或者包皮龟头部位出现的疖肿化脓，也可以表现为局部流脓。这种流脓感染的病原体一般以革兰氏阳性球菌为主，与淋球菌感染导致的尿道炎有明显区别。