在临床上，甲亢的治疗方法通常会有很多种，包括手术治疗、内科药物的治疗，以及在核医学科进行131碘治疗多种方法。这些方法各有利弊，需要根据患者的病情、年龄以及病程，来选择合适的治疗方法。
通常手术治疗，是通过手术的方法切除部分的甲状腺组织，这样可以使甲状腺激素分泌减少，而达到治疗的目的。适用于手术治疗的人群，是包括用药物治疗长达两年以上没有任何效果，或者药物治疗后反反复复的复发，对药物毒性有反应不能够坚持用药的患者。
但是，手术治疗也是有一些弊端，有一些并发症。比如手术中或手术后的出血，损伤喉返神经，引发甲状腺功能减退等一些的副作用。