做肠镜对人体是有一定损害，但是损害并不是很大。
肠镜检查属于一种有创操作，在检查的过程中内镜需要进入到肠道之中，有可能会对肠道的黏膜造成一定的损害，有部分人在肠镜检查结束之后有可能会出现肠道充气、黏膜渗血、黏膜水肿等症状，一般在休息之后这些症状就会得到改善，并且不会留下严重的后遗症。
患者肠道中如果本身就存在溃疡，在做检查的时候如果用力过大就有可能会导致肠道穿孔的发生，但是这种情况并不经常发生，如果出现肠道穿孔需要及时进行修复治疗。