早上起床口臭是因睡眠后口腔无法正常分泌唾液，因唾液可起到清洁口腔的作用，分泌不足则无法清洁口腔，导致口腔异味。
患有胃肠道疾病者，早晨起床后口腔也会有异味，如慢性胃炎、肠炎等，同时口臭也跟口腔疾病有关，比如患有牙龈炎、牙周炎、牙结石过多者，其牙齿表面会存在大量的细菌，细菌在口腔繁殖后会产生难闻的异味。
若晚上睡觉前未清洁口腔者，晨起后口腔也易出现异味，建议1年内去往医院洁牙2~3次，可有效去除牙菌斑及牙结石，减轻口腔异味症状。