胃空肠输入袢综合征的检查是腹部x线片、上消化道钡餐检查、内窥镜检查、腹部x线片见上腹部致密阴影和巨大气液平面有助于诊断，但大约只有1/4急性输入袢综合征病人有典型的x线表现。上消化道钡餐检查在急性病人诊断价值有限。内窥镜见邻近吻合口附近可发现机械性肠梗阻，有助于诊断。
急性病人可以表现为持续性的，上腹部剧烈疼痛向后背部放射，恶心、呕吐、呕吐物量少且不含胆汁。
慢性病人间歇性发作，餐后上腹部饱胀，上腹疼痛向后背放射，喷射性呕吐胆汁，几乎不含食物，上腹部可扪及包块，呕吐后症状消失。