婴儿肛周脓肿是不可以自愈的，不存在时间长了可以自愈的可能性。
婴儿发生肛周脓肿，其原因是肛周间隙和肛周软组织受到细菌感染引起的，是一种急性化脓性疾病。与反复腹泻引起肛隐窝感染，炎症继续蔓延有关。肛门局部会出现红肿、疼痛，可伴有发烧。
一旦形成后需要尽快手术治疗，切开脓包，促进脓腔内的脓液引流出来，再静脉点滴抗生素抗感染治疗，促进炎症吸收，伤口要每天消毒和换药。只有做好伤口的护理，才可以使肛周脓肿痊愈。因此，婴儿肛周脓肿是不可以自愈的。