前列腺囊肿一般不需要吃药，由于小囊肿对排尿、性生活以及日常生活不会造成影响，个体也无伴随症状。
但是前列腺囊肿如果伴随感染，则需要抗生素以及对症药物服用，常选择诺氟沙星类、吲哚美辛等药物，伴随全身症状的严重感染，还需要考虑静脉点滴方式给药。
较大的囊肿对尿道压迫和刺激，可能会出现排尿频率异常增多、尿潴留，严重影响日常生活以及工作，口服药物已经达不到确切的治疗效果，此时需要就诊临床全面检查，根据情况可以考虑手术方式切除囊肿。