心包囊肿是不会自己消失的。
心包囊肿是一种少见的长在心包的先天性的纵隔囊肿，为良性病变，一般生长缓慢，很多患者无明显症状，囊肿较小，可先观察一段时间暂不做手术。一部分患者囊肿较大，对心脏产生压迫，出现心悸、气短、胸痛等压迫症状，或者囊肿破裂则很容易出现继发感染，建议首选手术切除治疗，切除后很少复发，安全性较高，预后良好。
所以，建议不要期待囊肿自己消失，如果出现胸闷、胸痛、心悸、气短等症状，应及时到正规医院心外科就诊。