睡眠障碍的治疗具体要分析病因，然后进行相应的治疗。
引起睡眠障碍有可能是神经衰弱，主要是应用一些调节神经的药物，比如口服谷维素、安神补脑液、养血清脑颗粒。如果效果欠佳，可以应用小剂量的镇静催眠药，常用的有艾司唑仑、阿普唑仑、地西泮和劳拉西泮。也可以通过生活方式的改善来加以调理，比如规律作息，按时睡眠和起床，避免睡前喝咖啡和浓茶。可以在睡前听一些舒缓的轻音乐，用热水泡脚，冲个热水澡，喝杯热牛奶，有可能会改善。
如果是由于焦虑症引起的睡眠障碍，以抗焦虑治疗为主，常用的药有坦度螺酮和丁螺环酮。抑郁症的患者也可以出现睡眠障碍，主要是应用西酞普兰和米氮平抗抑郁治疗。