颅咽管瘤的手术入路和颅咽管瘤的位置和大小有关，有些部位的颅咽管瘤可以通过鼻腔进行手术，在神经内镜的指导下进行手术，属于显微外科技术，主要是和靠近蝶窦比较小的肿瘤，大多数肿瘤位于颅底。
有些颅咽管瘤的位置较深，通过内镜无法到达肿瘤的位置就需要进行开颅手术。
有些患者的肿瘤比较大，显微外科技术无法充分的暴露肿瘤，也需要进行开颅手术。开颅手术损伤较大，但是治疗比较彻底，微创技术损伤比较小，术后恢复比较快。