儿童筛查先天性甲状腺功能减退症，一般是直接抽血检查甲状腺激素及促甲状腺激素的水平。一般新生儿是在3天以后检查足跟血，看促甲状腺激素水平是否有升高。
正常新生儿促甲状腺激素的水平在0.49~0.67μIU/ml。如果出生的宝宝促甲状腺激素水平超过20μIU/ml时，就考虑患者是否出现先天性甲状腺功能减退症。
如果是出现这种情况，一般给予左甲状腺激素替代治疗，从小剂量开始，逐渐加量，然后定期检查甲状腺激素和促甲状腺激素的水平，最终调整至促甲状腺激素水平在0.49~0.67μIU/ml时，提示患者补充剂量合适。