宝宝秋季腹泻后，先要明确引起腹泻的病原菌，再给予抗感染、止泻、补充液体治疗可以逐渐恢复。
秋季发生腹泻大多是由于病毒感染引发的，一般起病比较急，主要表现为大便次数增多。如果严重时容易引起脱水，先要化验大便常规，确诊引起腹泻的病原菌。如果病毒感染引发的腹泻，属于自限性的疾病，只能对症治疗，给予蒙脱石散、益生菌等药物止泻，口服补液盐，防止出现电解质紊乱。
对于细菌感染引发的腹泻，可以给予头孢类的抗生素，比如头孢克肟、头孢地尼等抗感染，控制肠道感染才能逐渐恢复。