HPV39阳性不可以同房的。
HPV39阳性也就是人乳头瘤病毒，而且属于高危型，传染性极强，可以通过同房时传染给性伴侣。所以当发生HPV39阳性时是不可以同房的，感染此病毒容易诱发尖锐湿疣。即使佩戴避孕套同房也有可能会发生感染，因为也有可能会发生避孕套破裂而传染给对方。HPV病毒在体内持续感染的时间与人的体质有关。
当免疫力逐渐增强时有可能会自行清除。平时要定期复查HPV、结合宫颈癌筛查，预防宫颈上皮内瘤变。