小儿脑积水可以通过手术治疗，包括去除梗塞原因的手术、减少脑脊液分泌的手术等。
如果小儿有明显的颅内压增高的现象，可以采用脱水降颅压的治疗方式，降低小儿的颅内压，同时能纠正脑积水问题。在治疗过程中，还要进行营养神经、预防感染、对症治疗。很多小儿出现脑积水后都会影响智力，出现轻度的记忆力减退，伴随迟钝、淡漠等症状，严重者还会出现痴呆，少数会有激动，幻觉、易怒等症状。
小儿脑积水还会导致行动障碍，主要有起步困难、行走缓慢等异常症状。