四维彩超可以查出耳朵的畸形，但是四维彩超有一定的局限性，对于较小的器官如果不能正面拍到，对判断畸形结果有误差，对于耳道、睾丸等较为隐蔽的构造显示不清晰。
由于四维彩超受到检查时间和胎儿姿态的影响，每次检查只能记录局部影像，可能会存在一定的遗漏，在检查前吃点甜食有助于拍摄不同胎儿姿态下的影像。
由于四维彩超检查多在怀孕6月以内，所以在怀孕后期需要配合其它项目检查，排除特殊疾病如脐带绕颈、肺部发育不良、小头症等等。